В ходе Чикагской конференции разработчики Конвенции о международной гражданской авиации ожидали, что после войны будет создана структура наподобие Организации Объединенных Наций. Поэтому они вписали в Конвенцию положение, предусматривающее возможность того, что ИКАО станет одной из составных частей такой организации:
Статья 64:В отношении вопросов, касающихся авиации, входящих в компетенцию Организации и непосредственно влияющих на международную безопасность, Организация может, с одобрения Ассамблеи путем голосования, вступать в соответствующие соглашения с любой всеобщей организацией, учрежденной народами мира для сохранения мира.
В ходе первой Ассамблеи ИКАО, состоявшейся в мае 1947 года, 32 Договаривающихся государства, представленные на третьем пленарном заседании, единогласно приняли резолюцию A1-2. Она одобрила соглашение о взаимоотношениях с Организацией Объединенных Наций (ООН) и уполномочила Президента Совета подписать протокол о вступлении в силу соглашения о таких взаимоотношениях между ООН и ИКАО.
Президент Уорнер подписал протокол 3 октября 1947 года, и ИКАО стала специализированным учреждением ООН. В соответствии с этим соглашением каждая организация обязуется соответствовать определенным требованиям и может участвовать в работе другой организации в той степени, в какой это требуется для обеспечения выполнения соответствующих статей Чикагской конвенции и Устава ООН.
Несмотря на то что ИКАО оставалась независимым и автономным учреждением, приобретение ею статуса заинтересованной стороны в рамках Организации Объединенных Наций стало важным достижением, что в последующие годы принесло немалую пользу многим из ее Договаривающихся государств, прежде всего посредством Программы технической помощи Организации Объединенных Наций.
В качестве специализированного учреждения ООН ИКАО тесно в аимодействует с ООН, в особенности с Экономическим и социальным советом. В силу технического характера своего мандата ИКАО также тесно взаимодействует с другими специализированными учреждениями и международными организациями системы ООН, к которым относятся: